Der Anfang des Instituts geht in das Jahr 1979 zurück. Damals wurde Prof. Engelhardt Schleiermacher als Leiter der Abteilung für Humangenetik an das Institut für Anthropologie der Universität Mainz berufen.
Als Arzt begann er bald mit der Durchführung von humangenetischen Beratungen und Untersuchungen in universitätseigenen Räumen.
1990 erfolgte der Umzug in eigene Praxisräume.
Seit 1995 wird das Institut von Frau Dr. Almuth Friedrich-Freksa geleitet.